Beginning Perl for Bioinformatics - PDF

Скачать полную версию книги "Beginning Perl for Bioinformatics - PDF"

Beginning Perl for Bioinformatics by James Tisdall
Благодаря своей высокоразвитой способности выявлять закономерности в данных, Perl стал одним из самых популярных языков для анализа биологических данных. Но если вы биолог с небольшим опытом программирования или вообще без него, начать работу с Perl может быть непросто. Многим биологам трудно научиться применять этот язык в биоинформатике. Самые популярные книги по программированию на Perl часто слишком теоретичны и слишком сосредоточены на компьютерной науке для биолога, не владеющего программированием, которому нужно решать очень конкретные задачи. Книга "Начала Perl для биоинформатики" предназначена для того, чтобы вы быстро преодолели барьер языка Perl, подходя к программированию как к важному новому лабораторному навыку, раскрывая программы и методы Perl, которые сразу же пригодятся в лаборатории. Каждая глава посвящена решению определенной проблемы или класса проблем биоинформатики, начиная с самых простых и усложняясь по мере продвижения по книге. Каждая глава включает упражнения по программированию и обучает биоинформатике, демонстрируя и модифицируя программы, которые решают различные виды практических биологических задач. К концу книги у вас будет твердое понимание основ Perl, коллекция программ для таких задач, как разбор BLAST и GenBank, и навыки для более продвинутого программирования в области биоинформатики. В некоторых последующих главах более подробно рассматриваются конкретные темы биоинформатики. Эта книга подходит для использования в качестве учебника в классе, для самостоятельного изучения и в качестве справочника.
В книге рассматриваются:
- Основы программирования и работа с последовательностями и строками ДНК.
- отладка вашего кода
- Моделирование генных мутаций с помощью генераторов случайных чисел
- Регулярные выражения и поиск мотивов в данных.
- Массивы, хэши и реляционные базы данных
- Регулярные выражения и карты рестрикции
- Использование Perl для разбора записей PDB, аннотаций в GenBank и результатов BLAST


48
Просмотры
0
Лайкнули

Лицензии:

  • CC BY-NC-SA 3.0 PH
  • Ссылка автора не требуется

Поделиться в сетях

Информация о книге:

Комментарии (0) Добавить

Кликните на изображение чтобы обновить код, если он неразборчив
Комментариев пока нет. Ваш комментарий будет первым!